主角是塔莉亚,卡嘉利,阿斯兰的小说叫《机动战士高达SEED-DESTINY》，这本小说的作者是富野由悠季 创作的二次元、灵异、未来世界风格的小说，书中主要讲述了：C.E73年，距离前作的那场大战已经过了大约两年时光。当帕特里克·萨拉死后，引导PLANT前进的是稳健的新议长——基尔巴特·杜郎达尔。
而在阿斯兰退伍后，成为扎夫特首席精英的，则是出生在奥布的少年飞鸟真。
他的眼神中带着哀伤，不知道是否因为在先前的战争中失去了家人，成了孤儿的缘故。他是“战争悲剧”的真实写照。而他之所以加入扎夫特，想要前往战争的动机又是什么呢？是报仇？还是使命？
没有人知道这一点。
另一方面，阿斯兰来到了奥布，现在和卡嘉丽在一起，想保护卡嘉丽，同时又为了世界而奔走的使命让其烦恼不已。
投身于扎夫特的男子和舍弃了扎夫特的男子。在二人之路交错的地方，故事开始了……
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